MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Atopobium parvulum DSM 20469 chromosome

Total Repeats: 31231

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013203	AGC	2	6	175514	175519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783960
3502	NC_013203	CAA	2	6	175564	175569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257783960
3503	NC_013203	AAT	2	6	175598	175603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257783960
3504	NC_013203	GAT	2	6	175655	175660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783960
3505	NC_013203	CAG	2	6	175735	175740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783960
3506	NC_013203	TA	3	6	175859	175864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_013203	ACA	2	6	175882	175887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_013203	CTG	2	6	176066	176071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783961
3509	NC_013203	TCT	2	6	176091	176096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783961
3510	NC_013203	TGCAGA	2	12	176166	176177	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257783961
3511	NC_013203	ACT	2	6	176191	176196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783961
3512	NC_013203	GCG	2	6	176231	176236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257783961
3513	NC_013203	GCT	2	6	176266	176271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783961
3514	NC_013203	AGC	2	6	176273	176278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783961
3515	NC_013203	AAGT	2	8	176296	176303	50 %	25 %	25 %	0 %	257783961
3516	NC_013203	GTGTTT	2	12	176341	176352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_013203	AAG	2	6	176360	176365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_013203	AGT	2	6	176377	176382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783962
3519	NC_013203	TTC	2	6	176390	176395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783962
3520	NC_013203	ATG	2	6	176426	176431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783962
3521	NC_013203	ATC	2	6	176435	176440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783962
3522	NC_013203	CAT	2	6	176446	176451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783962
3523	NC_013203	TCA	2	6	176535	176540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783962
3524	NC_013203	GTTG	2	8	176621	176628	0 %	50 %	50 %	0 %	257783962
3525	NC_013203	CAG	2	6	176631	176636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783962
3526	NC_013203	GCA	2	6	176639	176644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783962
3527	NC_013203	CAC	2	6	176656	176661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257783962
3528	NC_013203	CTT	2	6	176705	176710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783962
3529	NC_013203	TCG	2	6	176772	176777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783962
3530	NC_013203	TTG	2	6	176784	176789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783962
3531	NC_013203	CAA	2	6	176800	176805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257783962
3532	NC_013203	CAT	2	6	176806	176811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783962
3533	NC_013203	TGC	2	6	176821	176826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783962
3534	NC_013203	ATC	2	6	176831	176836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783962
3535	NC_013203	TC	3	6	176916	176921	0 %	50 %	0 %	50 %	257783962
3536	NC_013203	GCTT	2	8	176932	176939	0 %	50 %	25 %	25 %	257783962
3537	NC_013203	TGACAT	2	12	176995	177006	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	257783962
3538	NC_013203	TCA	2	6	177078	177083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783962
3539	NC_013203	GCT	2	6	177107	177112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783962
3540	NC_013203	CTT	2	6	177197	177202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783962
3541	NC_013203	CCT	2	6	177211	177216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257783962
3542	NC_013203	CAG	2	6	177248	177253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783962
3543	NC_013203	TGCAGT	2	12	177295	177306	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257783962
3544	NC_013203	TTG	2	6	177405	177410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257783962
3545	NC_013203	TCGCAG	2	12	177435	177446	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	257783962
3546	NC_013203	ATC	2	6	177482	177487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783962
3547	NC_013203	TCA	2	6	177501	177506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783962
3548	NC_013203	CTG	2	6	177512	177517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783962
3549	NC_013203	TCA	2	6	177540	177545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783962
3550	NC_013203	CA	3	6	177544	177549	50 %	0 %	0 %	50 %	257783962
3551	NC_013203	GGCT	2	8	177562	177569	0 %	25 %	50 %	25 %	257783962
3552	NC_013203	TTC	2	6	177610	177615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783962
3553	NC_013203	CGG	2	6	177637	177642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257783962
3554	NC_013203	TGTT	2	8	177660	177667	0 %	75 %	25 %	0 %	257783962
3555	NC_013203	GTA	2	6	177701	177706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783962
3556	NC_013203	AGG	2	6	177759	177764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257783962
3557	NC_013203	CTG	2	6	177765	177770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783962
3558	NC_013203	AGG	2	6	177786	177791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257783962
3559	NC_013203	AGG	2	6	177832	177837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_013203	CT	3	6	177863	177868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3561	NC_013203	TCG	2	6	177936	177941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783963
3562	NC_013203	CGC	2	6	177947	177952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257783963
3563	NC_013203	GCGACC	2	12	177966	177977	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	257783963
3564	NC_013203	CGT	2	6	178005	178010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783963
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3567	NC_013203	CGTA	2	8	178288	178295	25 %	25 %	25 %	25 %	257783963
3568	NC_013203	ATG	2	6	178369	178374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783963
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3570	NC_013203	GAA	2	6	178630	178635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783964
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3579	NC_013203	CGA	2	6	179187	179192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783965
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3585	NC_013203	CAT	2	6	179421	179426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783965
3586	NC_013203	GCT	2	6	179445	179450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783965
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3590	NC_013203	TGAT	2	8	180035	180042	25 %	50 %	25 %	0 %	257783965
3591	NC_013203	TGC	2	6	180090	180095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783965
3592	NC_013203	GGT	2	6	180100	180105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257783965
3593	NC_013203	CG	3	6	180302	180307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3594	NC_013203	TGC	2	6	180359	180364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_013203	TAC	2	6	180385	180390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3598	NC_013203	GGAG	2	8	180473	180480	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_013203	T	6	6	180499	180504	0 %	100 %	0 %	0 %	257783966
3600	NC_013203	ATT	2	6	180508	180513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257783966
3601	NC_013203	GCG	2	6	180520	180525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257783966
3602	NC_013203	CAC	2	6	180589	180594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257783966
3603	NC_013203	TCA	2	6	180632	180637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257783966
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3607	NC_013203	TGC	2	6	180977	180982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783966
3608	NC_013203	CG	3	6	181105	181110	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3609	NC_013203	ACA	2	6	181183	181188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257783967
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3611	NC_013203	GAA	2	6	181254	181259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783967
3612	NC_013203	GTTGA	2	10	181299	181308	20 %	40 %	40 %	0 %	257783967
3613	NC_013203	TGA	2	6	181325	181330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783967
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3619	NC_013203	AAAG	2	8	181664	181671	75 %	0 %	25 %	0 %	257783967
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3992	NC_013203	CCG	2	6	200129	200134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3993	NC_013203	CTA	2	6	200157	200162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3994	NC_013203	CG	3	6	200261	200266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3995	NC_013203	CAG	2	6	200303	200308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257783984
3996	NC_013203	TCT	2	6	200333	200338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257783984
3997	NC_013203	CAA	2	6	200351	200356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257783984
3998	NC_013203	ATG	2	6	200431	200436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257783984
3999	NC_013203	AGA	2	6	200545	200550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257783984
4000	NC_013203	GCT	2	6	200582	200587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257783984

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